EMSA(凝胶阻滞实验)
EMSA凝胶/电泳迁移率实验技术服务常见问题
1、EMSA原理及方法
EMSA称凝聚阻滞实验或凝胶电泳迁移率检测,是一种用于研究转录因子和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,能对各类转录因子的DNA结合活性进行定性和半定量分析,是一项研究细胞信号转导通路的关键实验技术。
EMSA主要基于蛋白-探针复合物在在凝胶电泳过程中迁移较慢的原理。根据实验设计特异性和非特异性探针,当核酸探针与样本蛋白混合孵育时,样本中可以与核酸探针结合的蛋白质与探针形成蛋白-探针复合物;这种复合物由于分子量大,在进行聚丙烯酰胺凝胶电泳时迁移较慢,而没有结合蛋白的探针则较快;孵育的样本在进行聚丙烯酰胺凝胶电泳并转膜后,蛋白-探针复合物会在膜靠前的位置形成一条带,说明有蛋白与目标探针有互作。
2、看不到迁移条带
1)蛋白样本提取质量不高,蛋白降解或者提取量不足。
2)样本中没有可以与探针结合的蛋白。
3)探针与蛋白无特异性的相互作用。
4)转膜效率低,蛋白或者探针未转移到膜上。
5)曝光或者成像时间过短。
6)在Super-Shift EMSA测定中看不到Super-Shift DNA/蛋白复合物带还可能有以下原因:
a.抗体没有工作。不是所有的抗体都可以用于Super-Shift EMSA,只有对非变性蛋白的表面抗原决定簇起反应的抗体才能够用于Super-Shift EMSA。
b.测定的活化的DNA/蛋白复合物中没有希望检测的构成成分存在。此时既看不到Super-Shift的带,也看不到DNA/蛋白复合物的量的减少。
c.使用的抗体过度稀释。一般10~20 ul的反应液需要使用0.5~1 ul原倍的抗体。
d.多抗与DNA/蛋白复合物形成大的聚集物而不进胶。在这种情况下,虽然看不到Super-Shift的带,但应当可以看到DAN/蛋白复合物的电泳带明显减少。
https://www.ybzhan.cn/st116441/product_13374475.html
http://www.bluescapebiotech.com/SonList-765751.html
EMSA(凝胶阻滞实验)